Apenas casos muito específicos de exceção de pedra na vesícula podem ser tratados com uso de medicamentos que ajudam a diluir a formação e favorecem sua eliminação natural pelo organismo. Também é possível aplicar tratamentos por ondas de choque que fragmentam o cálculo e possibilitam sua eliminação.

Na maioria dos casos, porém, o tratamento da pedra na vesícula demanda a realização de uma intervenção cirúrgica. O procedimento realizado é remover todo o órgão doente. Isso é necessário pois, nesses casos, a vesícula é também a fonte causadora do problema, e há muitas chances de que ela acabe produzindo novas pedras após um tratamento mais conservador.

A intervenção cirúrgica para remoção da vesícula biliar se chama colecistectomia, e geralmente é realizada a partir de técnicas minimamente invasivas, nas quais o cirurgião do aparelho digestivo faz pequenas incisões no abdômen do paciente — por onde serão inseridos os instrumentos cirúrgicos e uma câmera microscópica que permite a observação das estruturas afetadas.